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      科學研究試劑

      高通量測序文庫構建試劑

      藥物研發試劑

      • N902-說明書.pdf

        大?。?/span>
        2021-07-09 14:30:38
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      VAHTS Serum/Plasma Circulating DNA Kit

      VAHTSSerum/PlasmaCirculatingDNAKit?適用于短片段cfDNA提取提取純度高,產量高,產物濃度測定準確提取cfDNA覆蓋度好,無偏好性,適于二代測序用建庫實驗兼容手動提取及自動提取程序適用于短片段cfDNA提取人cfDNA為平均長度180bp的短片段DNA,因此對較小的DNA片段回收率是評價cfDNA提取效率的關鍵因素。使用VATHS磁珠法血漿游離DNA提取試劑盒中的
      價格:
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      市場價
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      貨號:
      N902-01/02
      所屬分類
      游離DNA提取
      數量:
      -
      +
      庫存:
      19998
      暫時無貨
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      產品詳情
      FAQ
      組分
      說明書

      VAHTS® Serum/Plasma Circulating DNA Kit

      適用于短片段cfDNA提取

      提取純度高,產量高,產物濃度測定準確

      提取cfDNA覆蓋度好,無偏好性,適于二代測序用建庫實驗

      兼容手動提取及自動提取程序

      1.適用于短片段cfDNA提取

      人cfDNA為平均長度180 bp的短片段DNA,因此對較小的DNA片段回收率是評價cfDNA提取效率的關鍵因素。使用VATHS®磁珠法血漿游離DNA提取試劑盒中的磁珠提取DNA ladder(70-1000 bp區間),與原始DNA以相同稀釋倍數經Agilent 2100 DNA1000芯片檢測如右圖所示,提取后的DNA與投入DNA重合度高,基本無DNA片段大小偏好性。

      2.提取純度高

      使用VAHTS®磁珠法血漿游離DNA提取試劑盒提取血漿cfDNA,經Agilent 2100高敏芯片檢測,線條平滑,cfDNA峰型飽滿,其它位置無雜峰,顯示提取的cfDNA純度高,雜質少。使用提取的cfDNA進行用于二代測序的建庫實驗,建庫產量高,無雜峰,更適用于二代測序檢測。

      3.提取產量高

      與進口柱純化游離DNA提取kit(Q)和國產柱純化游離DNA提取kit(T)提取同一血漿樣本的游離DNA,經Qubit試劑盒(Thermo Fisher)測定濃度,VAHTS 磁珠提取產量少于Q及T柱純化產物,但經qPCR檢測血漿中摻入的痕量短片段外源DNA相對投入量的比例,VAHTS®磁珠提取的產量是Q柱純化的1.5倍左右,T柱純化的3倍以上,說明受Carrier RNA影響,通過Qubit測定的濃度不能反映實際cfDNA濃度,VAHTS®磁珠法提取試劑盒實際提取效率高于傳統柱純化方式。

      4.提取DNA濃度精確

      傳統柱純化法受到Carrier RNA加入的影響,測定濃度時比實際值偏大,影響后續操作判斷。VAHTS®磁珠法提取的cfDNA濃度準確,用Qubit試劑盒定量及用KAPA gDNA絕對定量試劑盒(KAPA hgDNA Quantification and QC Kit)做QPCR的定量結果吻合度高。

      5.兼容手動提取及自動提取程序

      手動提取最大樣本量可達16樣/次,操作時間<2小時/次。由于磁珠法無需離心換管等操作,因此同樣可適用于目前主流的自動核酸提取儀如KingFisher Flex Smart32游離DNA提取儀,可針對不同樣品量及樣品來源設定不同處理程度,簡單、快速的進行大規模提取,大大降低實驗者的工作量和實驗中的人為誤差,保證結果的穩定性和均一性。

      6.cfDNA構建文庫覆蓋度好,無GC偏好性

      使用VAHTS磁珠法血漿游離DNA提取試劑盒提取cfDNA,1ng投入建庫進行測序分析。測序平臺為X-Ten,cfDNA PCR文庫測序數據顯示GC含量正常,沒有偏好性;Q30在90%以上,說明測序數據質量較好;因cfDNA屬于高度片段化狀態,覆蓋度在60-70%,屬于正常范圍;dup rate普遍較高,和測序平臺有關;數據顯示幾乎沒有接頭殘留。

      VAHTS® Serum/Plasma Circulating DNA Kit為基于超順磁性的磁珠純化技術,針對血清/血漿樣本中短片段游離DNA富集定向優化的DNA提取試劑盒。超順磁性氧化硅納米磁珠具有分散度高、表面積大、吸附特異性好等特點,高效結合并富集DNA片段。

      本試劑盒應用于從較靈活起始范圍(200 μl~2 ml)的血清、血漿樣品中提取高質量游離DNA,操作簡單、快速,全程無有毒有機溶劑。針對低分子量核酸定向優化,具有DNA提取無偏好性、提取產量高、核酸純度高、重復性強等優點。得到的DNA可直接用于定量PCR和二代測序等實驗。兼容手動提取和自動提取流程,同時兼容無游離醛基的cfDNA采血管如Streck Cell-Free DNA BCT或VAHTS®游離DNA保存用采血管或普通EDTA采血管得到的血漿樣本。

        組分 N902-01 (50 rxns) N902-02 (200 rxns)
      Box1 VAHTS® Particles G 2 ml 8 ml
      Proteinase K 35 mg 4 × 35 mg
      Protease Dissolve Buffer 2.5 ml 8 ml
      Box2 Buffer SDS 6 ml 20 ml
      Buffer B 45 ml 160 ml
      Buffer W1 40 ml 120 ml
      Buffer W2 25 ml 2 × 40 ml
      Elution Buffer 10 ml 20 ml

      Box1,2-8℃保存;溶解后的 Proteinase K須保存于-20℃。

      Box2,室溫保存。

      關鍵詞:
      VAHTS Serum/Plasma Circulating DNA Kit
      N902
      未找到相應參數組,請于后臺屬性模板中添加

      Q1:使用N902提取的產物中有白色絮狀沉淀是怎么回事?

      A1:可能是4度保存的PK活性下降,導致蛋白去除不干凈,形成白色絮狀沉淀。建議不再使用,更換新的試劑。

      Q2:蛋白激酶K干粉和溶解后分別怎么保存?能否將蛋白激酶k溶解后保存在4°?

      A2:干粉2-8°保存,溶解后-20°保存。溶解后的酶不能保存在4℃,否則可能會有所降解;適當的解凍次數不影響,實在擔心可以進行分裝。

      Q3:N902提取的方法是磁珠法還是柱提法?

      A3:采用的是磁珠法進行提取。

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