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      Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

      科學研究試劑

      高通量測序文庫構建試劑

      藥物研發試劑

      • N407-V10.1.pdf

        大?。?/span>
        2020-07-20 17:22:08
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      Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

      Ribo-off? rRNADepletionKit(Bacteria)用于革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌的rRNA去除?兼容絕大多數的革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌高達97%的rRNA去除率完整保留mRNA與lncRNA以上表格為1?μg不同的細菌TotalRNA同時用Ribo-offTM?rRNADepletionKit(Bacteria)(Vazyme#N407)和Ribo-ZerorRNARem
      價格:
      9500.0
      市場價
      9500.0
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      貨號:
      N407-01/02
      所屬分類
      RNA模塊
      數量:
      -
      +
      庫存:
      19998
      暫時無貨
      1
      產品詳情
      FAQ
      組分
      說明書

      Ribo-off®  rRNA Depletion Kit (Bacteria)

      用于革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌的rRNA去除

      兼容絕大多數的革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌

      高達97%的rRNA去除率

      完整保留mRNA與lncRNA

      以上表格為1 μg不同的細菌Total RNA同時用Ribo-off® rRNA Depletion Kit (Bacteria)(Vazyme #N407)和Ribo-Zero rRNA Removal Kit (Bacteria)  (Illumina,MRZB12424)去除rRNA,并用VAHTS®Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit(Vazyme #NR603)進行后續的文庫構建,可以看出N407有優異的rRNA去除效率。

      Ribo-off®rRNA Depletion Kit (Bacteria)是針對革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌總RNA中去除rRNA的試劑盒。本試劑盒適用于起始量模板為1-5 μg的革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌總RNA,總RNA樣本經過rRNA與探針雜交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步驟,最終將rRNA(包括16 S和23 S rRNA)從總RNA中去除,保留mRNA和其它非編碼RNA,可用于LncRNA等非編碼RNA的分析;該試劑盒同時適用于完整的和部分降解的RNA樣本(例如FFPE RNA),所得的產物適用于RNA文庫及其他實驗。

      組分 N407-01 (12 rxn) N407-02 (24 rxn)
      rRNA Probe(Bacteria) 24 μl 48 μl
      Probe Buffer 36 μl 72 μl
      RNaseH Buffer 48 μl 96 μl
      RNaseH 12 μl 24 μl
      DNase I Buffer 348 μl 696 μl
      DNase I 12 μl 24 μl
      Nuclease-free ddH2O 1 ml 2 × 1 ml

      -20°C保存

      關鍵詞:
      ribo-off
      rrna
      rna
      革蘭氏
      去除
      kit
      bacteria
      陰性菌
      24
      陽性菌
      未找到相應參數組,請于后臺屬性模板中添加

      Q1:如果純化產物用于文庫構建,但是使用的是Nuclease-free H2O洗脫的,如何操作?

      若條件允許,加入等體積2 ×Frag/Prime Buffer,之后反應體系均放大,直至做到純化步驟,恢復體系,也可以再次使用VAHTS® RNA Clean Beads (Vazyme #N412)進行純化,最后用Frag/Prime Buffer洗脫。

      Q2:純化產物可以保存多久?

      純化產物可以在-20°C保存一天,在-80°C保存一個月。

      Q3:如果文庫濃度過低,可以從哪些角度去尋找原因并如何改進?

      以高質量的RNA樣品為模板構建得到的文庫濃度都能達到上機測序要求,如果無法提供合格的RNA樣品,可嘗試使用以下方法彌補:

      ◇起始量:提高樣品起始量,最大可做到5 μg;

      ◇做幾個重復的樣品,到二鏈合成純化步驟合并在一起,或做到文庫擴增前合并在一起;

      ◇做不分選方案:94°C 8 min打斷條件下RNA片段雖然偏小,但是分布會很集中,均一性也較好,有些個性化樣品會出現打斷不均一、某些大小的片段較多,經過PCR更明顯,出現刺峰,這種情況在不分選方案中出現很少。

      Q4:本試劑盒是否適合用于small RNA文庫制備?

      不適用。因為small RNA的長度僅為22 nt左右,而磁珠抓取片段最低為100 bp以上,無法有效富集到small RNA片段。

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