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      VAHTS Dual UMI UDI Adapters set1-set4 for Illumina

      科學研究試劑

      高通量測序文庫構建試劑

      藥物研發試劑

      • N351-N354-說明書.pdf

        大?。?/span>
        2021-04-28 16:34:42
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      VAHTS Dual UMI UDI Adapters set1-set4 for Illumina

      價格:
      28800.0
      市場價
      28800.0
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      N351/N352/N353/N354
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      產品詳情
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      組分
      說明書

      VAHTS® Dual UMI UDI Adapters set1-set4 for Illumina

      低頻突變檢測利器

      檢測低至0.1%低頻突變:助力低頻突變檢測,配合深度測序,有效挖掘低頻突變信息

      降低標簽跳躍和錯配:雙端唯一配對UDI,極大降低標簽錯配

      1. 檢測低至0.1%低頻突變:

      以腫瘤SNV 0.1% ctDNA標準品(含11個已知的突變位點)為模板,使用N351-N354和I*公司同類產品進行建庫,捕獲后上機測序,下機數據質量與I*公司同類產品相當。使用GATK4和Vardict兩款軟件進行低頻突變分析,對0.1%低頻突變的檢出優于I*公司同類產品。

      圖1. 下機數據質量及0.1%低頻突變檢出

      2. 基于測序的交叉污染質控:

      N351-N354接頭在出廠時均進行了基于測序的嚴格質控,避免交叉污染。使用單一片段建庫后進行測序,UDI標簽與單一片段連接的正確率可以達到99.99%,相對于單端接頭標簽錯配率大大降低。

      單端接頭

      N351-N352

      N353-N354

      圖2. 基于測序的交叉污染質控

       

      VAHTS® Dual UMI UDI Adapters set1-set4 for Illumina是適配于Illumina高通量測序平臺的DNA文庫構建試劑盒。試劑盒中VAHTS® Dual UMI Adapters for Illumina為不完整的雙端UMI-Y型接頭,可兼容多種A-T連接的文庫構建試劑盒。在接頭連接后,Insert DNA兩端分別添加上5 - 6 nt的Unique Molecular Identifier(UMI),可用于檢測低頻突變。此外,試劑盒中的VAHTS® UDI Primer for Illumina包含特異性搭配的Unique Dual Index(UDI),經文庫擴增后,可實現兩個完全獨立Index雙重檢驗,最大限度降低標簽跳躍和錯配(Index hopping & Index misassignment),從而保證最終進入分析流程的reads最接近樣品的真實情況。

      本套試劑盒由set1 - set4組成,每個set中均包含24種不同VAHTS® UDI Primer for Illumina以及 VAHTS Dual UMI Adapters for Illumina。

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      組分

      N351(96 rxns)

      N352(96 rxns)

      N353(96 rxns)

      N354(96 rxns)

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 001 - UDI 024)

      20 μl/each

       

       

       

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 025 - UDI 048)

       

      20 μl/each

       

       

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 049 - UDI 072)

       

       

      20 μl/each

       

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 073 - UDI 096)

       

       

       

      20 μl/each

       
      VAHTS® Dual UMI Adaptersfor Illumina

      480 μl

      480 μl

      480 μl

      480 μl

      單個DNA文庫DNA Adapter使用量依據起始模板投入量而定,具體使用濃度可參考附錄。

      -30 ~ -15℃保存,≤0℃運輸

      未找到相應參數組,請于后臺屬性模板中添加

      Q1:N351-N354與普通雙端接頭(N321-N322)有什么區別?

      A1:N351-N354是雙端UDI、UMI接頭。雙端UMI可以降低假陽性背景,有效提高低頻突變檢出效率。雙端UDI為特異組合的i5和i7,每一個i5和i7都是互不相同且一一對應的,可實現兩個完全獨立Index雙重檢驗,最大限度降低標簽跳躍和錯配。N351-N354無需自行搭配i5和i7,操作更簡便。

      Q2:使用N351-N354建庫后文庫結構?

      A2:

      相較于普通雙端接頭的文庫分子,使用N351-N354的文庫分子會含有12-14 bp的雙端UMI序列,會占用一定的數據量,推薦在上機時根據實際需求相應的增加10%的數據量。

      Q3:建庫中推薦使用接頭的稀釋倍數和體積:

      A3:

      組分

      N351(96 rxns)

      N352(96 rxns)

      N353(96 rxns)

      N354(96 rxns)

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 001 - UDI 024)

      20 μl/each

       

       

       

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 025 - UDI 048)

       

      20 μl/each

       

       

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 049 - UDI 072)

       

       

      20 μl/each

       

       
      VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 073 - UDI 096)

       

       

       

      20 μl/each

       
      VAHTS® Dual UMI Adaptersfor Illumina

      480 μl

      480 μl

      480 μl

      480 μl

      單個DNA文庫DNA Adapter使用量依據起始模板投入量而定,具體使用濃度可參考附錄。

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